第一话：帝都－花之华击团
这一天，身为海军少尉的大神一郎受到了花小路伯爵的推荐，派到被称为“帝国华击团”的秘密部队担任队长的职务，于是意气风发的他按照约定的地点来到了上野公园。这里樱花缤纷，游人如织，举目四望不远处一个身着和服的小姑娘姗姗走来，原来这位名叫真宫寺樱的女孩就是帝国华击团的成员之一。于是大神问道“能知道一些关于你的事情吗？”，得知她和大神一样也是才加入华击团的成员。
没想到奢华气派的大帝国剧场竟是华击团的秘密基地，刚一进大厅遇到了怀抱小熊玩具的小女孩爱丽丝，等樱走后听到餐厅那边有人叫他，过去遇到正在用餐的神崎堇，她以命令的口吻让大神去拿叉子，这时回答：“好的”，之后听她发了一肚子牢骚。来到经理室门口遇到一脸严肃的玛丽亚，虽然冷如冰霜但总算是见到一位比较象军人的人了。进入经理室去见米田中将，意外的是当初活跃在日俄战争的著名战略家竟会是一个醉态醺醺的糟老头，领到制服步出经理室，在门口遇到一脸窘态的樱和爱丽丝，看来她们俩有偷听的嫌疑，这时不要当面拆穿她们，说“能不能告诉我接待处的地点？”，两个人会争着要领大神去接待处，选“麻烦两个人带路”，来到大厅的接待处开始工作，在分手前对两人选择说“练习请多多加油”，这样会同时博得两位女孩的好感，如果在经理室门前没有理会或指责樱和爱丽丝，她们会逃掉，代之的是玛丽亚出现将大神领到大厅。
身为秘密部队的队长担任的居然是剪票的工作，与顾客交谈会有许多选择，尽量不暴露身份且态度和善就可以了，在顾客中有位年青人问大神是否喜欢神崎堇，这时选“她确实是我喜欢的类型”会得到一封书信。工作结束后决定去问问其他的队员，先到商店里找高村椿买一张剧照，有樱、堇、玛丽亚的，任选一张吧，但记住在以后的机会里要买不同的，集齐了六张剧照可以买到特制的卡片。来到楼梯口忽然双眼被人蒙住，这里要迅速猜出背后的人是“樱”，然后问“你有男朋友了吗？”，樱含羞走开了。来到后台遇到爱丽丝和小熊在一起玩，这时问她“关于爱丽丝的事”，观察她怀中的小熊，她会问大神那只小熊玩具的名字，答案是第三个“让.保罗”。来到道具室会遇到玛丽亚，说“告诉我关于帝国华击团的事”，她对此事也是讳莫如深。上二楼在书库会再次遇到樱，看样子她正在四处找堇小姐，离开后到沙龙看到堇正在哪里喝茶，这回她又将大神的名字喊错了，把手中那封戏迷的信交给她，不久樱赶到了，堇会直接地问大神到底喜欢堇和樱哪一种类型的女孩，这时可以任选一个（加一点好感度）或默不作答（不加分也不减分），当然追樱的机会是很多的，建议选堇。
回到一楼经理室前遇到事务局的藤井霞，她让大神去填报一份表格，说“我明白了”，在事务局里还遇到另外一个叫神原由里的女孩，填完表格终于可以见米田中将了，在门口无意听到他打的电话，进去后说“请你说明一下是怎么回事”，米田说这里不过是帝国歌剧团，是为政府收攒资金的单位而已，大神听了心里失望之极，神情沮丧地步出了经理室并在门口遇到了樱，她看出大神的神色不太好提出要陪他，回答“麻烦你了”，于是在她的陪护下回到了二楼，在门口看到樱脸泛红霞欲言又止，这时问“要不要进来坐一坐”，樱推说要上戏使跑开了。进入屋子后会有一次存档机会，同时可以看到各个女孩的状态。
夜色已深，心事重重的大神无心睡眠，这时樱来敲门说米田让他担任夜巡的工作，回答：“好，让我来吧~”，樱自愿担任向导的角色。夜巡只有八次行动机会，所以玩家在完成所有的事件前不要随便走动。来到阳台会看到樱望着窗外的闪烁灯光感慨万千，再赶到书库会遇到前来还书的玛丽亚，回答《战争与和平》的作者是“托尔斯泰”，到楼下服装室外会遇到哭啼啼的爱丽丝，原来她的小熊弄丢了，等她走后来到后台找到小熊玩具，再到二楼爱丽丝的房间还给她。这时也可以去堇的房间去看看，不过她看到大神和樱在一起会不高兴的，如果当初没有将信交给她，也可以这时给她。行动八次后樱会说时间很晚了，这时可以选“我还要继续巡逻”，这样还可以多看三个地方，之后选择“我送你回房去吧”。
第二天是休演日，终于可以摆脱剪票的工作了，选择“前往舞台”去看看，遇到樱和堇在排练中发生争吵，当堇挥掌要打樱时选择“阻止她们两个”，结果大神冲上去挨了一记响亮的耳光，但这样会同时博得樱、堇、爱丽丝、玛丽亚四位女孩的好感，还是值得的。离开舞台樱从后面追了过来，回答“好吧，你想说什么呢？”，她会将米田中将的话告诉大神，要从心里喜欢这个剧团和队员才可以胜任队长的职务。正说话的时候剧场内警报响起，所有成员在地下指令室集合，花组的人马终于可以出击迎敌了。
这次的任务迎战上野会园黑之巢会的机械兵，下达命令“花组，出击了”，队员登上光武乘着子弹列车来到了上野公园。战斗操作会由玛丽亚仔细讲解，玩过战棋的玩家不难上手，注意大神会有特殊技能—保护，它可以让大神替女主角承受攻击，请尽量将八次机会用完，这样三位女孩的好感度会大大增加。在战斗中还会与樱聊一次天，选择“这里是与你初次遇到的地方哩”。战斗结束后，大伙到上野公园看樱花，美丽的夜色中大家都醉态可掬地嘻笑着，此夜之后大神又要回到剧场剪票的岗位上了。
第二话：敌名是黑之巢会
大帝国剧场的厅廊，大神正在进行值班，这时堇小姐过来说将有一个成员前来报到，待她走后听外面一声轰隆巨响和尖叫声，一个满身油污的红衣女孩跑了进来，大神问她“你没事吧？”，得知她就是今天前来报到的中国女孩李红兰，接着她要去见经理米田先生，这时说“那么，就让我带路吧”。在路上可以先到商店逛一下，买一张李红兰的剧照，再到餐厅聊一会儿，谈到与黑之巢穴的战斗回答她“这也不算什么啦”。走到经理室门口遇到了换装的樱，调查她的服装然后夸她的服装“很好看啊”，樱走后红兰会问起与樱的感情怎么样，回答她“很好啊”，对她说“希望以后管我叫哥哥吧”。进屋见过米田后，接下来的任务是送红兰回房间，在二楼遇到一身笔挺男装的玛丽亚，回答她“身为队长，这是当然的事啦”。在玛丽亚和李红兰走后，爱丽丝会出现问大神与李红兰的感情怎样，回答她“是啊，感情很好啊”。回到一楼的事务局，藤井霞和神原由里将一摊子事都扔给了大神，大神只好垂头丧气地投入到无聊的工作中，身为帝国华击团的队长，不仅要剪门票还要伏案整理一大堆劳什子传票，最近对自已真是越来越没有自信了。
累了一天回到屋里终于可以休息一下了，这时传来敲门声，说“请进，门是开的”，原来是红兰前来拜访，她问大神白天看了她的表演吗？回答“舞台上的红兰真的好漂亮啊”，回答玛丽亚所扮的角色名字为“安德烈”，然后说“我好想去红兰的房间啊”。等红兰走后开始夜间巡逻了，先来到堇的房间听她说要到地下室做每天的训练，于是来到地下室的泳池见到一身泳装的堇，观察她的泳装说“好怪的设计啊，泳装的边缘上装饰太多了”，接下来得知她要在布满迷你水雷的游池中游泳，她邀请大神时选“好，游吧”，待她进去后听到泳池中发出一声尖叫，由于没有做热身运动她的脚抽筋了，回答她“等等，我马上来”，之后玩一个“帝国飞鱼”的小游戏，水面上有一些飘浮的水雷，要避开它们在24秒钟之内游到堇所在的位置，如果中途碰到水雷会被炸退一段距离，这样时间就不够用了。如果援救成功堇会真心道谢，如果失败她会责怪队长是不可信赖的人。然后到浴室会听到堇洗澡的声音，记得不要去偷窥哦。到红兰的屋里会看到一大堆的行李，接着观察她的头发要她放下发辫，然后和红兰玩一会“花牌”这个小游戏，玩法会逐步讲解的，但要记住不同牌组的花色。
在和红兰和堇玩过两个小游戏后到别的地方转一下吧，在一楼的舞台上看到努力练习的樱，还是不要打扰她。到二楼爱丽丝的房间聊一下，观察她的睡袍并称赞“很好看啊”。来到阳台遇到看夜景的玛丽亚，问“倒是玛丽亚有什么事吗？”，待她走后大神思忖着她所说的“幸运地活下来的缘故”是什么意思。
结束夜巡后回到屋子里休息，如果先前没有去过红兰的房间，在睡梦中会被红兰打一顿。天亮后又开始剪票的工作，结束工作之后到舞台那边看看情况，不想在演出中粗心大意的樱出了一点小失误，竟将整个舞台给弄塌了，在大家互相指责的时候上前“阻止堇”，接下来大神主动承担了修复舞台的工作，会得到所有女孩子的好感呢，不过答应容易做起来难，还好樱会留下来陪着，在谈话中说“你也在很努力地练习”。樱离去后劳累之极的大神不小心砸到了手指，这时出现一位美丽的女人为他做了护理，大神不由魂飞魄荡，心猿意马起来，忽然背后有人狠狠地拧了一下，回头看去原来是醋心大发的樱，在她走掉后在地上找到了一盒精致的便当，于是选择“到樱的房间”道谢，在门口直接选“我是大神”才会见到她，否则她会情绪不佳避而不见的。回到屋子里回想轰轰烈烈的一天，还有那个谜一样的美丽女人，不觉便在幻想之中甜甜地沉睡过去。
醒来后大神还在想着那个女人，来到剧场时警报再度响起，大家于是迅速赶到地下司令室集合待命，从米田口中得知黑之巢会正在袭击芝公园，于是大伙坐上光武乘翔鲸丸赶到了芝公园。这一战敌人有炮台上阵可以直线攻击，不过我方也可以利用蒸汽补给站来恢复体力，同时李红兰的远程和群体攻击很强，所以还是胜算无虞的，同样要记得战斗中将八次保护机会用掉哦。将地面的敌人全部清除后，塔顶的天海总帅会跳下来加入战斗，这时最好不要硬碰硬打，队员站到蒸汽补给站附近与之缠斗，等几个回合之后敌人本体出现，队员再一起将本体消灭就行了。战斗结束后回到翔鲸丸上再次见到了那位在舞台上碰到的美人，才知道她就是华击团的副司令藤枝菖蒲。
第三话：我不配当队长！？
又从一天的剪票工作中解脱出来，正要四处逛逛却在大厅遇到情绪低落的玛丽亚，她问大神一个问题，回答“这个嘛，常常梦到哦”，待她走后霞过来说玛丽亚背错台词的事，说“人总会有疏忽的时候”。来到商店顺便买张剧照，到餐厅会遇到一位胃口可怕的客人（桐岛神奈），来到服装间会遇到樱，她也正在为玛丽亚的事情担心呢，然后到二楼菖蒲的房间聊一会儿。走到舞台见大家正在忙着修理道具，这时发生了柱子倒塌事件，身为队长的大神只好双手托住，虽然托得很痛苦还是“装作蛮轻松的样子”，在危急时刻由冲绳归队的空手道高手桐岛神奈登场，直接回答她“我叫大神一郎”，在互作介绍后大家到沙龙听桐岛讲旅途上的见闻，这时发觉玛丽亚不在，桐岛要求大神陪她去找玛丽亚，回答“没问题”。到了晚上两人来到锻练室开始切磋格斗术，第一招选“下段踢”，第二招选“防御腹部”，第三招选“上段回旋踢”。在切磋之后桐岛要下厨房做料理，回答“那我就不客气了”，在她做饭的时候最好不要催她，只要耐心等待就行了，之后和她聊一会儿天（没有时限），大神最后被她称为“看上去顺眼的男人”。
到二楼的时候遇到神色忧郁的玛丽亚，她打声招呼就走开了，在走廊里大神拾到了一个坠子，这时玛丽亚出现说是她丢失的，回到房间想这几天玛丽亚没有精神可能与这个坠子有关吧，那个坠子里面到底隐藏着什么秘密呢？
警报响起大家在司令室集合，这次黑之巢会的魔操机兵在废屋区出现，敌方率队的是蓝刹那，战斗中神奈会问该怎样打，回答“到最前线去”，场景中的油桶可以用远程攻击来炸掉，当队员移到上方桥口时，大神为了救一个小男孩而让蓝刹那逃走了。当大神从离奇的梦魇中醒来时已在自已的房间里了，问床边的樱“那小孩结果怎样了？”，喝过红兰做的苦药后便又昏睡了过去。
到了晚上恍惚中有人潜进房间，一只冰冷的手抚在大神的额头，那人离开不久神奈来访，聊了一会儿大神又头痛了起来，不知过了多久醒来看到玛丽亚正坐在房里，她斥责大神不该救那个小孩，回答“不是那样子”，玛丽亚说为一时冲动而不顾大局的话是无法胜任指挥官的，大神也没有资格作队长。等她离开后大神抚心自问“没有做错”，于是到决定玛丽亚房间再找她谈谈，在门口的到屋里面的谈话，当神奈要出来时选择“躲藏起来”，结果因体力不支昏倒在了书库，醒来时是在医务室里，菖蒲小姐正在细心料理大神的病情，在菖蒲的一番开导下大神坚定了最初的信念，决定再去找玛丽亚谈谈。
玛丽亚不在房间里，先到书库见到伏案打盹的红兰，选择“将她背回房间”。来到一楼舞台会遇到找鞋子的堇，应她的要求按摩肩膀吧。来到大厅终于找到了玛丽亚，可是她却一溜烟跑到了剧场外面，这时意外地遇到了蓝刹那，等他走后问“克瓦瑟利是......”，玛丽亚无言离去。
回到房间神奈急冲冲地敲门，说玛丽亚自已开光武出去了，来到指挥室听菖蒲讲出玛丽亚的一段悲伤往事，接下来的战斗可以避开左边的敌人，直接绕到玛利亚的机体旁边，发现玛丽亚不在里面，在机体左边拾到了个项坠。这时蓝刹那再次出现，按照他的条件大神一人跳上了派来的气船，就在与蓝刹那激战大神形势危急的时候，花组队员及时赶到并成功地将玛丽亚解救出来，接下来的战斗只要全力歼灭蓝刹那就行了，只是这家伙每回合行动两次，注意保护离他最近的队员，将八次保护机会用完再杀掉他。
第四话：暴走！暴走！大暴走！
大神又投入到事务室理整传票的无聊工作中，完工回房的时候遇到了樱，得知爱丽丝在对台词的时候跑掉了，并邀请大神参加明天大道具间的大扫除，回答“当然好，我帮你”，这时爱丽丝欢快地跑过来说明天要与大神约会，这时迟疑地回答“这个嘛......”，然后再爽快答应“好，走吧”，等樱走后与爱丽丝交谈选“包在我身上”，可陪爱丽丝到服装间去选衣服，这时玩一个老虎机的迷你游戏，要将帽衣鞋子搭配协调才行，转动十次转盘要达到150分以上才能博得爱丽丝的好感。 如果在第一次直接答应爱丽丝，会降低樱的好感，如果在第二次征求樱的意见“樱，我去没关系吧”，这样会直接跳到第二天，就玩不到选衣服的小游戏了。
第二天早上打算去爱丽丝房间接她，但这是自由活动时间，先到大道具间去看看扫除中的樱吧，可以选择“要不要我帮忙”帮她打扫并玩到一个打扫的小游戏，注意行动中不要碰到箱子和老鼠。然后再到商店去买张剧照，在餐厅会遇到狼吞虎咽的神奈，回答她早餐吃“白米饭和味噌汤”，在二楼在阳台会遇到玛丽亚，她会问起七夕会人们会做些什么，选择“装饰长条诗签”，并选择在诗签上写关于“玛丽亚”的事。来到爱丽丝的房间称选她的洋装“好可爱喔”，于是两人的约会正式开始了。
来到街上蒸汽火车正好开过来了，选择“到浅草看活动照片”，到达地点后先去买东西，在小贩面前称爱丽丝为“女朋友”，买一件廉价的项链轻易地俘获了爱丽丝的芳心。再选择到公园去并“手牵着手走”，在休息的时候她会问明天她几岁，选“10岁吧”。最后到活动相片馆去，在看影片的时候爱丽丝由于心生恐惧而激发了灵力，将整幢建筑震成了一片瓦砾。
回到剧场大神受到了米田的训斥，当玛丽亚责怪爱丽丝时，说“这全都是我不对”，如选择让爱丽丝道歉会降低玛丽亚的好感度。爱丽丝负气跑回房间，大神冲出门外看到堇、神奈和红兰被撞倒在地上，选择“先救起这三个人”，然后到爱丽丝房门前却吃了个闭门羹，大神这时选谁进去说服都会失败，众人散去后在走廊遇到菖蒲小姐，她讲出爱丽丝讨厌将她做小孩子看的心理，选择“玛丽亚的想法是对的”。
天亮后到爱丽丝房间去看望她，这时可以选择“亲吻爱丽丝”也可以不做动作，结果是一样的，爱丽丝负气驾驶光武离开了基地，就在这时警报响起，黑之巢会的机兵在浅草一带出现，大神于是下达命令“帝国华击团，出击吧！”率领队员赶往浅草。在战场上找到了爱丽丝，选择“先把爱丽丝救出来”，让樱和大神站到爱丽丝的两侧就可以用真诚来说服她了。
重整队伍后派爱丽丝利用空间瞬移到最右边小院里去打阀门装置，行动中白银罗刹会问大神那个队员最重要，这时只要不选爱丽丝就好了，假使选樱就要在她身上使用特技——保护，樱会被传送到罗刹的身边承受攻击。雷门打开后队员进去用必杀技围攻罗刹，很快就可将他消灭了，在战斗中让爱丽丝走到大神旁边可对敌人施展合体绝技。
第五话：用少女的心意让花朵绽放
由堇和神奈主演的搞笑版《西游记》上演了，结果两人在台上打得不可开交，台下也是怒目相对一触即发的样子，大神劝说也是无效，这时玛丽亚过来说米田长官要见大家。进入自由活动后到商店买张剧照，然后分别到堇和神奈的房间去探望，说“我在担心XX”，再说“我们两人一起到哪里去玩吧”分别邀请两人单独约会。
来到地下作战室，听米田中将说深川的废屋与黑之巢穴有所关联，于是大神、堇和神奈接到了前去侦察的任务。自由活动时先来到地下机库去见红兰，在这里让红兰将队员的光武分别改进和攻击型或防御型，选择李红兰的光武为攻击型，最后的算术题选中间的答案。在作战室看到玛丽亚和樱在讨论爱丽丝的战法，选三十六计走为上策为“中国古代的兵法”，与樱对话选择“又多了一位可靠的同伴了”。
在门口与堇和神奈汇合然后来到深川废屋，进入大厅后堇和神奈又大吵了起来，结果两人分道扬镳，这时要选择追其中一个，不论追谁结果是一样的。如果选追堇在左边的接待室与神奈汇合，听她讲述刚才的发现，然后到二楼门廊再次见到神奈，进入屋子里神奈的手臂缠到了蛇，帮她弄掉后选择“把毒从伤口吸出来”，听她讲起一段往事后选择“现在有我在啊”、“不要说丧气话”，然后到一楼的寝室一找到急救箱可惜里面的瓶子是空的，到二楼餐厅可找到另一只同样的瓶子，给神奈涂上药后说“我只是做我应该做的事而已”，追到右边的门里遇到了堇，进到屋子又有蜘蛛掉到堇的手臂上，接下来的剧情与神奈的相仿，去找消毒药，在一楼的佣人房间和二楼的寝室三的地上各拾到一串钥匙，最后打开一楼的休息室找到蜘蛛的消毒药。来到一楼餐厅再次遇到神奈，用钥匙打开锁着的门发现敌人的踪迹，这时神奈和堇的身后同时出现毒蛇和蜘蛛，选择“用手将它们打掉”使她们两人和好如初，一路追出去发现了红弥勒率领的机甲部队，选择“拖时间”，不久队友们驾着翔鲸丸赶到。
接下来的战斗兵分两路，首先要将队伍在桥头合在一块，然后往上边强攻，经过红兰调整过的光武果然战斗力增强了不少，再加上神奈和堇可与大神合体攻击（气满的话），因此这一仗并不难打，尤其要注意的是不要与敌人的炮台站成一条直线。接近红弥勒后会出现红蜂队，只要将这几只敌人打掉就完成任务了。
第六话：帝都大崩溃！？
花组的夏日公演终于结束了，工作结束后和椿打个招呼吧，不过最好不要邀请椿吃饭，否则会引起樱的不满。来到餐厅遇到神奈，他正在忙着寻找一个小孩，问她“要我帮忙吗？”就可以玩一个找孩子的迷你游戏，然后再返回到商店买一张剧照，来到楼梯口遇到了樱，选择“和她一起”来到二楼的沙龙，与每个女生谈谈，与堇说话时选“我也想成为堇的猎物哦”，与爱丽丝说话时选“下次就一起来吧”，与红兰说话选“打起精神来吧”，与玛丽亚对话选“表现出坦率的高兴”，与神奈交谈得知九月七日是她的生日，猜她“二十岁吧”。接下来讨论庆功宴的事情，大家分头去忙着准备工作了。
自由活动时间先到厨房去拿东西，找到杯子、刀子和火柴后与忙碌一团的玛丽亚说“要我帮忙吗？”，之后玩一个做汤的小游戏，首选切萝卜，然后调味品放法是番茄膏X3，肥肉X2，酒醋X2，番茄酱X3，糊椒盐X3，最后再调节一下灶火就完成了，看看玛丽亚会给你打多少分吧。然后到地下仓库去帮神奈将桌子搬到后台，并将身上的道具交给爱丽丝，再跑到仓库找神奈谈话这时宴会就要开始了。在席间发觉出去买饮料的樱还没有回来，李红兰出主意要扮鬼吓一下樱，不想樱却被窗外的一声炸雷给吓到了。
赶到地下作战室去见米田中将，米田说黑之巢穴每袭击一地会留下一件太古祭器，从而完成一个足以操控帝都的魔法阵。在更衣室遇到了樱听她讲述童年的故事，这时第二声炸雷响起，红弥勒派出的红蜂队开始进攻帝国大剧场了，其他的五名队员驾驶光武出去迎战，而大神看到惊慌一团的樱便选择“用力抱住她”，终于使她安静了下来。接下来要想办法离开这里，调查地面樱拾到了一支手枪，用它就可以将墙壁破开出去了，不想在开枪的时候触发了樱潜在的灵力打碎了墙壁，两人逃到机库驾驶光武前往迎战。
这一战开始五名队员被困在一间屋子里，派大神和樱到前面墙上打那个闪亮的开关，队员同时补好血杀光屋子里的敌人，退出来到蒸汽站上补血，然后返回到屋子里打倒保养品开启第二道开关，所有队员冲到最里间击败红弥勒战斗结束。在红弥勒逃走后，黑之巢会的六破星降魔阵也在这时启动了，帝都在巨响中迅速崩溃，而樱听到这可怕的声音立时昏倒在了地上......
第七话：决战！拚死一搏！
昏迷的樱被运送到医务室仍然无法恢复她的意识，当队友前来探看时大神没有告诉她们实情，在走廊上遇到神奈，心中烦乱的大神还是故作高兴来安慰她。来到作战会议室见米田已准备了壮志成仁的决心，大神建议让花组再次出击，虽然敌众我寡但是不能轻易放弃希望，在决定时选择“直接冲入敌人的大本营”干掉天海，这样帝都的魔法阵就会消失了。根据蒸汽计算机所运算的结果在地图上投射出一个巨大的光点，这时选择“我觉得那不是天海”，无论选那一个结果还是一样的，花组队员开始前往光团的地点。抵达后发觉果然是个圈套，四周出现了大队的敌兵，选“不要做无谓的牺牲”，危急时刻樱驾着翔鲸丸赶到，接下来大伙跟着樱撤离这个地方。
回到翔鲸丸上与樱对话，问“是怎样的一个梦？”，接着米田讲起五年前的降魔战争，推测出天海在封魔之门的日本桥。这一战兵分两路，开战前大神可以选三个中意的队员组成一队，可以用保护特技给她们加分哦。来到地下发现有一道被封印的门，要解开它须摧毁三个圆形的建筑，只要攻击建筑的大门就可以了，注意近卫会两次攻击。将三个建筑破坏掉打开封印大门，在里面终于找到了天海，所有队员用必杀或合体两个回合就能将他打败了。接下来是第二轮战斗，天海的力量有所加增，周围还召唤了八个近卫，还好其他队员及时赶到，全力以赴迎接这场战斗吧，在集中力量将天海打倒后，所有队员发动身上的灵力将这个家伙永远地从地球上消失了。
第八话：和平的日子就去约会吧！
不觉间已到元旦了，大伙共聚一堂互贺新年。回到房间后米田中将找大神议事，刚出房间碰到樱来邀请新年参拜，答应她吧。来到经理室见到米田得到放假的机会，与菖蒲小姐说过话后进入自由活动时间。到二楼去找樱，在称赞的时候选“是在说你本人啊”，两人于是搭上蒸汽火车来到了明治神宫，这里人群熙来攘往到处弥漫着节日的气氛，许愿之后来到庙会上，在一个小摊床前可玩到一个打靶的小游戏，打满一百分后得到了奖品项链，把它送给樱吧，在要离开的时候意外地遇到了其他的队员，原来他们是一直跟来的。
就在这个时候遇到了叉丹和鹿猪蝶黄昏三骑士，同时召唤出降魔进攻过来，还好菖蒲小姐驾驶翔鲸丸适时赶到，队员们乘上光武上前迎战。结果降魔的防御超强，一回合后依照菖蒲的建议将所有队员移到院子里端，空中的翔鲸丸炮击下面的降魔部队，这样敌人的防御会降低很多，再派队员上来将四名降魔打败即可，战斗结束后发现队员所有的光武不能行动了。
第二天明治神宫出现怪物的事上了报纸，帝都人民再次受到黑之巢会新的威胁，大神作为队长也理所当然地受到了米田的训斥。回到房间后碰到红兰来访，说光武已经没有办法修复了，若要研制新的武器资金是个大问题，于是大神决定去找米田商量一下，然后再到地下会议室与队员商量对付魔物的方法，选“需要强力的武器”，但最后的结果还是依照队员各自决定来行事。
不觉三个星期过去了，队友们又回到了久违的帝国大剧场，在与樱、神奈和玛丽亚谈过话后是自由行动时间，在餐厅遇到神奈，选择“我什么都吃啊”。到舞台会遇到跳舞的樱，说“你真的很喜欢舞台表演呢”。在地下机库遇到了看守的霞，这时是进不去的。在二楼的书库遇到了玛丽亚，聊了几句后赶到沙龙，在这里遇到喝茶的堇，再来到爱丽丝的房间见菖蒲小姐也在里面，聊了一会儿后听闻警报响起，于是所有队员再次集合在了会议室，接着来到机库见到了新制作完成的神武，帝国华击团再度出击。
神武的力量果然增强许多，打怪物简值是剖瓜切菜，但在接近猪的时候要注意他的必杀技，队员之间不要靠得太近，在他补气的时候一拥而上连施必杀，最多两个回合就可打倒他。
第九话：最终武器出现
连续几个夜晚，菖蒲小姐都被奇怪的梦境纠缠着。这一天早晨大神正在沙龙看书却难解其中的意思，这时玛丽亚过来说也看过这本书，正说话的时候爱丽丝拿果汁过来不小心摔了一跤，这时可“将爱丽丝抱住”，然后问询爱丽丝或玛丽亚，分别得到两人好感度。接到指令来到地下仓库去见米田，得知可利用剑、珠、镜三件魔神器就是进入圣魔城的钥匙，是对付目前无比强悍的降魔取得这场战争胜利的最后王牌。
到了晚上，大神在房间正在整理思绪，这时樱敲门走进来斥问白天的事情，这时要选“敷衍一下”，因为米田交待过要保守秘密的。在巡逻的时候遇到神色怪异的菖蒲忽然一把呃住了自已的喉咙，还好樱及时赶到救下了大神。这时警报响起降魔来袭，大神一路追到地下仓库再次见到痛苦不堪的菖蒲，从她手上拿到了一把手枪，菖蒲嘱咐他在自已遭遇不测时使用。
这一战是鹿率领降魔怪物入侵帝剧场，战场上有四个闪着绿光的装置可以召唤降魔，要派几个小组逐一消灭掉，但帝剧场的两个门口要留守一定的兵力，尽量别让降魔冲到里面去，因为里面的机关是撑不过几个回合的。将四个装置破坏后场上的所有降魔消失，接着打跳下来的鹿，在战斗中与他对话选“就这样而已啊”会激怒他，打他也较容易些了。
在叉丹的召唤下菖蒲盗走了魔神器，然后在叉丹的一吻之下变成了最强的降魔——杀女（在这里选不选开枪结果是一样的，所以还是不要开枪为好）。由于菖蒲的事，花组所有成员的情绪陷入低落之中，大神作为队长要去找每个人谈话。神奈正在一楼餐厅吃东西，在二楼书库会遇到李红兰，沙龙会遇到堇，在阳台则会遇到樱，玛丽亚和爱丽丝都可以在房间里找到，在与每个队员交谈过后再到经理室找米田说话。
作战室内米田说出有关圣魔城的事情，其中的灵子炮可以将大地化为蒸汽，因此花组必须尽快赶往东京湾阻止圣魔城的复活。接下来的战斗是对付蝶的部队，战场上会有很多电击塔，靠近会大力杀伤队员，因此要绕道而行或者在一回合内将它摧毁。最后要小心蝶的必杀雷舞电死牡丹可以攻击大范围的队员，队形尽量分散并集中在一两回合内打倒她。
第终话：最后的审判
圣魔城终于被叉丹复活了，时间已刻不容缓，作战室内与每个队员对话然后再倾听米田的意见，虽然势态不容乐观，帝国华击团的队员们还是抱着一死的决心再次乘坐翔鲸丸出击，马上就要与菖蒲小姐为敌作战了，大神不由得忧心忡忡，这时樱过来鼓励他勇敢地面对战斗，要和花组成员们一起来面对难关。
翔鲸丸的火力不足以摧毁圣魔城的大门，这时米田动用了最后的秘密武器——空中战舰三笠，将圣魔城的大门打开后花组队员顺利地闯到里面，这一战敌人比较密集且数量众多，尽量利用爱丽丝和红兰的群体攻击打头阵，然后队员再上前补击，利用樱和大神的合体也可以同时灭掉七八名敌人，因此要好好利用合体的机会哦。 第一战结束后复活后的猪鹿蝶黄昏三骑士现身，神奈将队员送入门内自已一人断后，终因寡不敌众以身殉职，接着堇、红兰、玛丽亚、爱丽丝也不幸遇难，最后大神和樱遇到了菖蒲化成的杀女，两个人开始决斗，然而大神始终不肯出手，最后樱冲上前挡住了致命一击，大神终于摆脱了迷惘的心态振作精神上前打败了杀女。与叉丹的战斗只要集中打叉丹就行了，必杀和合体可以打掉一多半血，再来两回合的一般攻击即可结果他，但其间要注意恢复和防御。
三笠号受到降魔的重创已无法继续战斗，米田中将驾驶着残破的战舰打开所有引擎冲向最后的目标圣魔城，而此时死掉的叉丹复活并变身为魔王撒旦，也就是被打入地狱的天使长路西法，他开始施展法力让世界陷入黑暗和混乱，死掉的菖蒲这时也化身为天使长米迦勒，运用法力将死掉的同伴们再次复活，最后所有的花组成员升上天空与最后的魔王展开较量。期待已久的故事结局开始了，各位玩家慢慢欣赏吧。
大结局：帝剧最长的一日
虽然最终打败了撒旦，但游戏还没有结束呢，在与女孩们共同生活的日子里还会有许多有趣的事情发生。在公演休息的一天里，大神有许多事情要做。首先在早晨可以出去逛逛，到每个女孩的房间里可以玩到一个迷你游戏，这些游戏在以前的章节里都可以找到（如果照着攻略来打的话），分别有帝国的飞鱼、选衣服、做料理、找小孩、玩花牌、打扫道具间。再到菖蒲的房间她会问你十个问题，这些问题是会变化的，下面整理出部分答案。
一：这三个人被谁压扁的？3：爱丽丝
二：你和樱第一次见面的地方是？2：上野公园
三：在商店里卖剧照的女孩是？2：椿
四：天海发动的魔法阵名是？1：六破星降魔阵
五：下列地名中位于地下房间的为？2：医务室
六：红弥勒所率领的部队是？2：红蜂队
七：樱所用的必杀技为？1：破邪剑征—樱花放神
八：堇都是如何称呼你的？3：少尉
九：是谁推荐你担任花组队长的？2：花小路伯爵
十：影像题：这三个人在看着什么东西？2：红弥勒和胁侍们
十一：堇最怕的是哪一个？2：蜘蛛
十二：第二话的壁纸是？1：百合
十三：你去深川调查时，红兰正在做什么？3：整备光武
十四：建有帝都塔的地方是？1：芝公园
十五：与爱丽丝约会时所看的剧名是？1：世纪大发现—珍兽大登场
十六：樱父亲的名字是？3：真宫寺一马
十七：爱丽丝一人乘光武所去的地方？1：浅草
十八：天海向政府所要的赎金是多少？3：100亿
十九：剧照要多少钱一张？2：50钱
二十：玛丽亚从前的代号是？3：食火鸡
以上只是初级问题的一部分，还有许多问题需要玩家自已探索，连续答对十道题后菖蒲仍不会把事情告诉你，这时要去李红兰的房间去玩花牌，赢过她一次后再回来与菖蒲对话，这时可以回答高级的问题，的确要比先前难许多，下面是整理出的部分答案。
一：神奈的生日是？2：9月7号
二：影像问题：在这之后你做何举动？3；醒了过来
三：神奈被蛇咬到的房间是？2：二楼起居室
四：与神奈过招时的最后一招是？3：上路回旋踢
五：准备《西游记》庆功宴时堇在做什么？2：整理装备室
六：曾经夜晚出动的地方是？3：日本桥
七：堇的迷你游戏标题是？1：帝都的飞鱼
八：花屋敷分部的所在地是？1：浅草
九：黑之巢会埋楔时所念的咒语是？2：嗡奇力奇力巴撒朗巴塔
十：影像问题：樱失去记忆的原因是？这时默不作答就行了
十一：刹那的机兵苍角的特征是？2：可以移动两次
十二：放有电风扇的房间是？3：准备室
十三：红兰机车的马力是？2：100匹
十四：樱房间里的照片上是哪个城市？3：青叶城
十五：樱的配剑名称是？1：荒鹰
十六：上野公园牌坊上最右边的是？2：蓝刹那
十七：影像题：这门是谁的房间？3：爱丽丝
十八：曾做东西给你吃的是？2：神奈
十九：影像题：这出公演剧的题目是？2：西游记
二十：下列工作中哪一个是你做过的？2：传票整理
二十一：和由里同期的队员是？3：红兰
二十二：经理室里没有的东西是？时钟
二十三：这把手枪是谁的？3：玛丽亚的
二十四：和小狗拍明星照的队员是？1：堇
二十五：舞台损毁时，玛丽亚怀中抱的人是？1：樱
玩家在连续回答对下道高级问题后，可以跟着菖蒲去沙龙和大家一起参加花牌大赛，在分别赢过六位女孩后最后和菖蒲小姐决战，赢过了她后会变身成杀女，一局定输赢。玩过花牌大赛后还可以到处逛一下，在大厅可遇到由里，在她那里可以听到整部游戏全部曲子，到二楼客席可以遇到霞，从她那里可以回顾以前的剧情片断，到阳台上可以遇到椿，可以观看以前所买过的剧照，如果集齐了六张还可以买到特大剧号的剧照，在书库还可以碰到米田中将，他可以给你替换场景切换时的过渡画面。如果玩累了可以回房休息一下，回答樱的问题选休息一会儿，这样在梦里可以玩到射击的迷你游戏。如果选择睡觉，则整部游戏正式结束。
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